Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms