Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnnm1Q0GA42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms