Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pate4Q09098 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms