Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms