Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms