Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SctQ08535 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SctQ08535 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SctQ08535 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms