Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms