Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnn1Q08091 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnn1Q08091 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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