Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms