Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms