Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms