Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarcad1Q04692 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms