Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcr5Q04683 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms