Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms