Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms