Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Aplp1Q03157 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aplp1Q03157 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms