Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms