Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nucb1Q02819 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nucb1Q02819 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nucb1Q02819 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nucb1Q02819 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nucb1Q02819 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms