Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms