Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms