Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms