Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RykQ01887 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RykQ01887 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RykQ01887 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RykQ01887 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RykQ01887 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms