Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms