Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms