Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms