Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EgfrQ01279 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms