Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelpQ01102 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelpQ01102 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms