Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms