Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrcdQ00LT2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms