Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yy1Q00899 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yy1Q00899 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms