Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms