Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp4Q00724 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms