Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms