Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms