Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PgrQ00175 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms