Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms