Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AlkP97793 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AlkP97793 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
AlkP97793 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AlkP97793 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AlkP97793 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AlkP97793 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AlkP97793 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlkP97793 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms