Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcc1P97496 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms