Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pitx2P97474 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms