Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bop1P97452 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms