Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp1P97350 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms