Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-3P97334 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms