Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgcgP82348 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms