Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb2P81069 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms