Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx1P81068 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms