Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cct3P80318 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cct3P80318 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms