Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctps1P70698 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms