Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3r1P70441 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms