Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tp53bp1P70399 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tp53bp1P70399 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms