Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms